临床数据与标准 开源项目 高级
OHDSI ATLAS
面向 OMOP CDM 的队列定义、特征分析和真实世界证据研究 Web 应用。
- 医学子领域
- 临床数据与标准
- 资源类型
- 开源项目
- 开源协议
- Apache License 2.0
- 部署方式
- Docker Compose（通过 OHDSI Broadsea 部署 ATLAS + WebAPI）
部署引导
快速部署
Docker 命令
涉及患者数据的项目请仅用公开或脱敏数据集，部署说明可能随项目更新变化
git clone https://github.com/OHDSI/Atlas.git
cd Atlas
docker compose up -d简介
OHDSI ATLAS 是 OHDSI 生态中的 Web 应用，用于 OMOP CDM 数据源浏览、队列定义、特征刻画、概念集维护和观察性研究设计。ATLAS 通常需要 WebAPI、数据库和 OMOP CDM 数据源配套使用。
部署步骤
- 安装 Docker、Docker Compose V2 和 Git。
- 使用 OHDSI Broadsea 启动 ATLAS/WebAPI 栈：
git clone https://github.com/OHDSI/Broadsea.git
cd Broadsea
docker compose --profile default up -d- 等待容器启动后，打开：
http://127.0.0.1- 在 Broadsea 首页点击 Atlas 链接。
- 查看运行状态：
docker compose ps- 停止服务：
docker compose stop- 真实研究使用前，需要接入机构自己的 OMOP CDM 数据库、词表和安全配置。
适用场景
- 真实世界研究队列定义和可视化审查。
- OMOP CDM 数据库质量探索和概念集维护。
- 药物流行病学、观察性研究和多中心网络研究设计。
- 教学环境中演示 OHDSI 技术栈。